Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SbdsP70122 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms