Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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