Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VimP20152 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VimP20152 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
VimP20152 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VimP20152 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VimP20152 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VimP20152 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VimP20152 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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