Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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TtrP07309 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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TtrP07309 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TtrP07309 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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