Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Car8-201ENSMUST00000066674 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Tert-201ENSMUST00000022104 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Pnp-201ENSMUST00000178092 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm13863-201ENSMUST00000118782 602 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rhag-201ENSMUST00000024721 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Igkv3-3-201ENSMUST00000103402 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Igkv3-1-201ENSMUST00000103404 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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