Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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