Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hdac5Q9Z2V6 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms