Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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