Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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