Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Rnf17Q99MV7 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf17Q99MV7 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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