Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rprd1aQ8VDS4 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rprd1aQ8VDS4 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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