Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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