Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SnupnQ80W37 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SnupnQ80W37 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms