Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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Dsg1bQ7TSF1 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms