Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PtprdQ64487 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PtprdQ64487 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PtprdQ64487 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PtprdQ64487 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PtprdQ64487 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms