Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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