Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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