Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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