Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Top2aQ01320 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms