Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms