Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Chd1P40201 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Chd1P40201 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Chd1P40201 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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