Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms