Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Magi2-215ENSMUST00000208219 3266 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Trpd52l3-201ENSMUST00000025727 2231 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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