Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb2P13373 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms