Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms