Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Tfpi-206ENSMUST00000111718 2027 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 6430550D23Rik-202ENSMUST00000109617 1872 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Dnajc5b-204ENSMUST00000165693 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Trim39Q9ESN2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim39Q9ESN2 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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