Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms