Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnft1Q9DCN7 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms