Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ubqln4Q99NB8 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ubqln4Q99NB8 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms