Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43836-201ENSMUST00000196532 381 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm42634-201ENSMUST00000197362 381 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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PtprtQ99M80 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprtQ99M80 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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PtprtQ99M80 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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