Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms