Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ChfrQ810L3 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms