Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Dsg1bQ7TSF1 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms