Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Olfr155-202ENSMUST00000107860 3480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pgk2-201ENSMUST00000033585 1592 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Arl14epl-201ENSMUST00000097580 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm42575-201ENSMUST00000202942 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Kcns3-202ENSMUST00000164495 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mboat2-202ENSMUST00000110942 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Lpar1-204ENSMUST00000107574 3437 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm19127-201ENSMUST00000207067 2445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Btnl6-201ENSMUST00000075483 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 CT572991.1-201ENSMUST00000222755 1423 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mcm10-202ENSMUST00000102985 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc23-201ENSMUST00000032218 1470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Mapre2-201ENSMUST00000025127 4026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr582-204ENSMUST00000214021 3108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Apod-202ENSMUST00000115230 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm15179-202ENSMUST00000152799 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Fmo5-201ENSMUST00000029729 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrc43Q3V0L5 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms