Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Slc44a1-202ENSMUST00000107645 2365 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Zfp740-203ENSMUST00000119800 3882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm42605-201ENSMUST00000199565 385 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm44267-201ENSMUST00000204132 385 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm45674-201ENSMUST00000210043 450 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Treml4Q3LRV9 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Treml4Q3LRV9 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Treml4Q3LRV9 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms