Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Defa6P50704 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Defa6P50704 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Defa6P50704 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms