Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TfamP40630 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TfamP40630 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms