Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
RxraP28700 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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RxraP28700 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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