Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IfnabL7MTU6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IfnabL7MTU6 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms