Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rrn3B2RS91 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms