Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Samt1A2BED8 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms