Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 AC123665.5-201ENSMUST00000226648 1392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm16494-201ENSMUST00000165525 261 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Higd1aQ9JLR9 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms