Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms