Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nup155Q99P88 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Nup155Q99P88 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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Nup155Q99P88 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nup155Q99P88 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms