Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf17Q99MV7 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rnf17Q99MV7 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf17Q99MV7 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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