Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprtQ99M80 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms