Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Csmd1Q923L3 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms