Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Lrif1Q8CDD9 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Lrif1Q8CDD9 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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