Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms