Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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AtmQ62388 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
AtmQ62388 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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